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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  11/08/2021
Data da última atualização:  11/08/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F.
Afiliação:  JULIANA MAINENTI LEAL LOPES, Universidade Federal de Juiz de Fora; ELYABE MONTEIRO DE MATOS, Universidade Federal de Juiz de Fora; CRISTIANE ZORZATTO, Universidade Federal de Juiz de Fora; ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MICHAEL CHESTER, Royal Botanic Gardens; LYDERSON FACIO VICCINI, Universidade Federal de Juiz de Fora.
Título:  Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020
DOI:  https://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Microsatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets.
Palavras-Chave:  Simple sequence repeat; SSR.
Thesagro:  Genética; Marcador Genético.
Thesaurus Nal:  Phyla (Verbenaceae); Polyploidy.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL25182 - 1UPCAP - DD
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Registros recuperados : 22
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1.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, N. N.; SANCHEZ, L. M. B.; LOPES, J. M. Tolerancia de ovinos ao hidroxido de sodio e/ou sodio residual contido em cama de frangos de corte. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.20, n.4, p.487-495, abr. 1985.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, N. N.; BONNECARRERE, L. M.; LOPES, J. M. Valor nutritivo da cama de frangos de corte formada de casca e de palha de arroz tratada com hidróxido de sódio, para ovinos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 18, n. 11, p. 1279-1287, nov., 1983.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Unidades Centrais.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; SILVEIRA, F. G. da; LOPES, J. M.; MARCHIORI, L. F. S. Avaliação da fertilização com vinhaça "in natura" ou concentrada e interação com adubo nitrogenado na cana-de-açúcar e na fertilidade do solo. In: SIMPÓSIO TECNOLOGIA DE PRODUÇÃO DE CANA-DE-AÇÚCAR, 7., 2015, Piracicaba. [Anais...]. Piracicaba: Equilíbrio Editora, 2015. p. 33-36.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoZORZAN, M. H. S.; COSTA, P. T. C.; LOPES, J. M. Avaliação da Eficiência Biológica de Fontes Protéicas de Origem Animal em Dietas Iniciais para Frangos de Corte. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.24, n.1, p. 85-90, jan.1989
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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5.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, E. de; OTERO, J.; COSTA, P. T. C.; LOPES, J. M. Efeitos das fontes e níveis de cálcio no desempenho de poedeiras. III - correlação e regressão entre três medidas de avaliação da qualidade da casca dos ovos no verão. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 14., 1977, Recife. Anais... Recife: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1977. p. 160-162.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, E. de; OTERO, J.; LOPES, J. M.; COSTA, P. T. C. Efeitos das fontes e níveis de cálcio no desempenho de poedeiras. II - níveis de cálcio do calcário moído na produção e qualidade dos ovos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 14., 1977, Recife. Anais... Recife: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1977. p. 145-146.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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7.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, E. de; OTERO, J.; LOPES, J. M.; COSTA, P. T. C. Efeitos das fontes e níveis de cálcio no desempenho de poedeiras. I - níveis de cálcio da farinha de ostra na produção e qualidade dos ovos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 14., 1977, Recife. Anais... Recife: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1977. p. 132-133.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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8.Imagem marcado/desmarcadoALDA, T. B. L. de; COSTA, P. T. C.; LOPES, J. M.; TOLEDO, G. S. de. Desempenho Produtivo de Cinco Linhares de Aves da Raça Leghorn Branca e Dois de Seus Cruzamentos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 24, n.5, p. 503-508, maio 1989
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCRUZ, F. G. G.; COSTA, P. T. C.; LOPES, J. M.; TOLEDO, G. S. P. de. Redução dos Níveis de Fósforo Inorgânico na Alimentação de Frangos de Corte Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, V. 25, n. 1, p.1-7, jan.1990
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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10.Imagem marcado/desmarcadoLABUTO, L. B. D.; LOPES, J. M. P.; SOUSA, Z. A. R.; ANDRADE, V. N.; BORGES NETO, C. R. Arranjamento de clones e minipreparação de DNA - protocolos otimizados. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 30
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, J. M. L.; CAMPOS, V. R.; REIS, A. C.; MATOS, E. M. de; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; GRAZUL, R. M.; VICCINI, L. F. Aneuploids and its increment on diversity of Lippia alba polyploid complex: genetic aspects and origin. Molecular Biology Reports, v. 49, n. 8, p. 7743-7752, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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12.Imagem marcado/desmarcadoLABUTO, L. B. D.; LOPES, J. M. P.; SOUSA, Z. A. dos R.; ANDRADE, V. do N.; BORGES NETO, C. R. Protocolos otimizados para arranjamentos de clones e minipreparação de DNA Brasilia: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. 4 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Circular Técnica, 23).
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSIQUEIRA, J. T. da C.; REIS, A. C.; LOPES, J. M. L.; LADEIRA, L. O.; VICCINI, L. F.; BRANDAO, H. de M.; MUNK, M.; SOUSA, S. M. de. Chromosomal aberrations and changes in the methylation patterns of Lactuca sativa L. (Asteraceae) exposed to carbon nanotubes. Biologia, v. 78, p. 1991-2002, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, R. M.; SILVA, R. R. DOS S.; SANTOS, A. S. DOS; SILVA, C. V. DA; MAGALHAES, J. A.; FOGACA, F. H. dos S.; LOPES, J. M. Desempenho de juvenis de tambatinga em sistema recirculação água com diferentes densidades de estocagem. Research, Society and Development, v. 9, n. 5, e178953317, 2020. 17 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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15.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F. Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species. Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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16.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, J. M.; BOIJINK, C. de L.; FLORINDO, L. H.; LEITE, C. A. C.; KALININ, A. L.; MILSOM, W. K.; RANTIN, F. T. Hypoxic cardiorespiratory reflexes in the facultative air-breathing fish jeju (Hoplerythrinus uniataeniatus): role of branchial O2 chemoreceptors. Journal of Comparative Physiology. B, Biochemical, Systemic, and Environmental Physiology, v. 180, p. 797-811, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, R. M.; SILVA, R. R. dos S.; SANTOS, A. S. dos; SILVA, C. V. da; MAGALHAES, J. A.; FOGACA, F. H. dos S.; LOPES, J. M. Tambatinga juveniles performance in a recirculation aquaculture system with different stocking densities. Research, Society and Development, v. 9, n. 5, e178953317, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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18.Imagem marcado/desmarcadoVILLELA, J. G. A.; FALEIRO, F. G.; ALMEIDA, B. C. de; REZENDE, E. H.; JUNQUEIRA, N. T. V.; GUIMARAES, T. G.; ANDRADE, G. A. de; LOPES, J. M. M.; BASTOS, F. M. D. Banco de germoplasma "Flor da Paixão": fotodocumentação, situação atual e perspectivas (2009). Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. 1 folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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19.Imagem marcado/desmarcadoVILLELA, J. G. A.; FALEIRO, F. G.; ALMEIDA, B. C. de; REZENDE, E. H.; JUNQUEIRA, N. T. V.; GUIMARAES, T. G.; ANDRADE, G. A. de; LOPES, J. M. M.; BASTOS, F. M. D. Banco de germoplasma "Flor da Paixão": fotodocumentação, situação atual e perspectivas. In: ENCONTRO DE JOVENS TALENTOS DA EMBRAPA CERRADOS, 4., 2009, Planaltina, DF. Resumos apresentados... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. p. 98-99 (Embrapa Cerrados. Documentos, 243).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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20.Imagem marcado/desmarcadoGOMES, S. S. L.; LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; CABRAL, E. G.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CAMPOS, J. M. S. de; MENINI NETO, L.; VICCINI, L. F. Phenotypic variation seems not to be associated with the genetic profle in Zygopetalum (Orchidaceae): a case study of a high‑elevation rocky complex. Molecular Biology Reports, v. 51, article 582, 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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